Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN3P54252 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN3P54252 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms