Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GSK3BP49841 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms