Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTAP49354 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTAP49354 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTAP49354 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTAP49354 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTAP49354 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTAP49354 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTAP49354 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTAP49354 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTAP49354 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms