Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YLR374CYLR374C 390 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MFM1YPL060W 1242 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SPO19YPL130W 672 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 NAT3YPR131C 588 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SSH1YBR283C 1473 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 ATG2YNL242W 4779 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 POL12YBL035C 2118 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 DAS2YDR020C 699 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YER085CYER085C 522 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 ARO2YGL148W 1131 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 IRC9YJL142C 393 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 PEX22YAL055W 543 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SET6YPL165C 1122 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 NRG2YBR066C 663 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 DBP3YGL078C 1572 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MCM2YBL023C 2607 nt4.01□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MNL1YHR204W 2391 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 DRN1YGR093W 1524 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 GGA1YDR358W 1674 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 RGP1YDR137W 1992 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 THI7YLR237W 1797 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SPT23YKL020C 3249 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 ELO3YLR372W 1038 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SHE1YBL031W 1017 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 FMP30YPL103C 1407 nt4□□□□□ -1.77
DDI1P40087 TPA1YER049W 1935 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 GAD1YMR250W 1758 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 PRP9YDL030W 1593 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MAL13YGR288W 1422 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 RPL24AYGL031C 468 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 LOH1YJL038C 660 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 PRM9YAR031W 897 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YNL296WYNL296W 315 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 DCS2YOR173W 1062 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 PWR1PWR1 941 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 ATG14YBR128C 1035 nt3.99□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YDR444WYDR444W 2064 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SET4YJL105W 1683 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 HSP42YDR171W 1128 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YRA2YKL214C 612 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SIW14YNL032W 846 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YNL143CYNL143C 393 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SPS19YNL202W 879 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 UMP1YBR173C 447 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YBR219CYBR219C 384 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SUL2YLR092W 2682 nt3.98□□□□□ -1.77
DDI1P40087 DEG1YFL001W 1329 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 OAF1YAL051W 3144 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 CDC6YJL194W 1542 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 GRS2YPR081C 1857 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 APC1YNL172W 5247 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YDL012CYDL012C 324 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 ARF2YDL137W 546 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YEL028WYEL028W 462 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 YGL262WYGL262W 528 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MRPL24YMR193W 777 nt3.97□□□□□ -1.77
DDI1P40087 TAF12YDR145W 1620 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MAG2YLR427W 2013 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YER067C-AYER067C-A 324 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 LSB1YGR136W 726 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 SAE3YHR079C-A 276 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 SPO12YHR152W 522 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MDL1YLR188W 2088 nt3.96□□□□□ -1.78
DDI1P40087 TFA1YKL028W 1449 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YIL001WYIL001W 1542 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MNN4YKL201C 3537 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 RTC1YOL138C 4026 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 NTH1YDR001C 2256 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YIL165CYIL165C 360 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YIL171WYIL171W 330 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 ISY1YJR050W 708 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 ATG33YLR356W 594 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MRPL39YML009C 213 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YMR010WYMR010W 1218 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YBL059WYBL059W 582 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 SUI1YNL244C 327 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YNR042WYNR042W 429 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 ISA2YPR067W 558 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 LAS1YKR063C 1509 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 ZRC1YMR243C 1329 nt3.95□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MTR10YOR160W 2919 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 IMG2YCR071C 441 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YDL027CYDL027C 1263 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 VPS29YHR012W 849 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 RPS1BYML063W 768 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 CWC25YNL245C 540 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 PUT2YHR037W 1728 nt3.94□□□□□ -1.78
DDI1P40087 VPS36YLR417W 1701 nt3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms