Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	YIL001W	YIL001W	1542 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	TMA17	YDL110C	453 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	NUP42	YDR192C	1293 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	MRPL25	YGR076C	474 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	KTR2	YKR061W	1278 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	MRPL24	YMR193W	777 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	NCE102	YPR149W	522 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	IMD2	YHR216W	1572 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	ISR1	YPR106W	1332 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YER158C	YER158C	1722 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YCR006C	YCR006C	474 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	LPP1	YDR503C	825 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YLR036C	YLR036C	612 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	MRPL3	YMR024W	1173 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	AST1	YBL069W	1290 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YIL092W	YIL092W	1902 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	SEO1	YAL067C	1782 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	PDR5	YOR153W	4536 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	GPI18	YBR004C	1302 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	ADP1	YCR011C	3150 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	KEX1	YGL203C	2190 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YDR445C	YDR445C	408 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	COS4	YFL062W	1140 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	SKI8	YGL213C	1194 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	WSS1	YHR134W	810 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	GPP1	YIL053W	753 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	CYC1	YJR048W	330 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	COS3	YML132W	1140 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	VPS68	YOL129W	555 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	MFM1	YPL060W	1242 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	COS2	YBR302C	1140 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	EKI1	YDR147W	1605 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	TIP20	YGL145W	2106 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	YDL109C	YDL109C	1944 nt		3.46	□□□□□ -1.85
VMA11	P32842	IKS1	YJL057C	2004 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MEF2	YJL102W	2460 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YML020W	YML020W	1995 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RPS11A	YDR025W	471 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	API2	YDR525W	330 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MIC26	YGR235C	702 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	LOH1	YJL038C	660 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MHO1	YJR008W	1017 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YLR122C	YLR122C	378 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	SRB6	YBR253W	366 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	LAP3	YNL239W	1365 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YPK9	YOR291W	4419 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TOG1	YER184C	2385 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TAF12	YDR145W	1620 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RPC53	YDL150W	1269 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YJL218W	YJL218W	591 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RPS0B	YLR048W	759 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YBL029W	YBL029W	1131 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	DSC2	YOL073C	969 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YOR131C	YOR131C	657 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YPL073C	YPL073C	486 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	SET6	YPL165C	1122 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	OM14	YBR230C	405 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	POP4	YBR257W	840 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	BBC1	YJL020C	3474 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MAL13	YGR288W	1422 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	NUP133	YKR082W	3474 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	GAS5	YOL030W	1455 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YDL228C	YDL228C	642 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	SRB5	YGR104C	924 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	NAT2	YGR147C	867 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	UTP11	YKL099C	753 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YLR407W	YLR407W	687 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	SNF8	YPL002C	702 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	FMP30	YPL103C	1407 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MTR10	YOR160W	2919 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	EAR1	YMR171C	1653 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	snR7-S	snR7-S	179 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	AAD6	YFL056C	639 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	BIO2	YGR286C	1128 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RAD27	YKL113C	1149 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YRA2	YKL214C	612 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	FBP1	YLR377C	1047 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	NRG2	YBR066C	663 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	VID28	YIL017C	2766 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	THI7	YLR237W	1797 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YBR138C	YBR138C	1575 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	WHI4	YDL224C	1950 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	GRS2	YPR081C	1857 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	INO2	YDR123C	915 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86

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