Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBMS1P29558 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms