Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA2P24043 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA2P24043 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA2P24043 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms