Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41P11171 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41P11171 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41P11171 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41P11171 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41P11171 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41P11171 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41P11171 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41P11171 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41P11171 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms