Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRFP10586 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms