Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms