Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24BO95487 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms