Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRATO95237 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRATO95237 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRATO95237 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRATO95237 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRATO95237 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRATO95237 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRATO95237 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LRATO95237 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRATO95237 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRATO95237 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRATO95237 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRATO95237 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms