Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAMTA2O94983 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMTA2O94983 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms