Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN3O75935 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms