Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUBNO60494 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUBNO60494 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUBNO60494 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUBNO60494 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUBNO60494 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CUBNO60494 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUBNO60494 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUBNO60494 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms