Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ccl25O35903 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccl25O35903 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms