Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF646O15015 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF646O15015 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms