Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms