Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNL1A8MU46 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNL1A8MU46 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNL1A8MU46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms