Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDYE4A6NLX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms