Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP73A6NFT4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms