Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RQJ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms