Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms