Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms