Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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