Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms