Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm6341-201ENSMUST00000119683 411 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm14686-201ENSMUST00000119926 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 AC100729.1-201ENSMUST00000225458 1454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Amigo3Q8C2S7 Cryaa-206ENSMUST00000228716 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm33351-202ENSMUST00000215428 1677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Amigo3Q8C2S7 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Amigo3Q8C2S7 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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