Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TBCCD1Q9NVR7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms