Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms