Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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