Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms