Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO1Q9P1Z2 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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