Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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