Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms