Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp5Q9Z2P8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms