Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AUP1Q9Y679 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AUP1Q9Y679 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms