Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK2Q9UPX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms