Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCND1Q9NSA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.2 ms