Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms