Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tysnd1Q9DBA6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms