Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spc24Q9D083 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms