Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED1Q99966 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms