Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L2Q96SF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L2Q96SF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms