Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRAMP1Q96RY5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms