Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP57Q96MR6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms