Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms