Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKA2Q8WVK7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms