Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
C9orf84Q5VXU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
C9orf84Q5VXU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms