Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTL5Q5HYW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms