Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mindy4Q3UQI9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms